這是一篇針對(duì)實(shí)驗(yàn)室萌新寫的關(guān)于CRISPR-Cas9技術(shù)的詳細(xì)介紹,對(duì)于實(shí)驗(yàn)室老手也建議收藏轉(zhuǎn)發(fā)給師弟師妹,這樣省心省力,又能節(jié)省大量講解時(shí)間,這不香么?簡單來講,CRISPR-Cas9是一種分子生物學(xué)技術(shù),通過這種技術(shù)科研人員可以對(duì)細(xì)胞和生物體內(nèi)的基因進(jìn)行編輯。所謂的基因編輯就是通過某種生物手段和技術(shù),對(duì)生物體內(nèi)的遺傳物質(zhì)進(jìn)行修改。
這是一篇針對(duì)實(shí)驗(yàn)室萌新寫的關(guān)于CRISPR-Cas9技術(shù)的詳細(xì)介紹,對(duì)于實(shí)驗(yàn)室老手也建議收藏轉(zhuǎn)發(fā)給師弟師妹,這樣省心省力,又能節(jié)省大量講解時(shí)間,這不香么?
人體有著一套復(fù)雜且高效的免疫系統(tǒng),時(shí)刻保護(hù)著我們免受病毒和細(xì)菌的攻擊。但是,對(duì)于弱小又無助的原核細(xì)胞而言,它們也是急切需要被保護(hù)的。為此,經(jīng)過幾億年的進(jìn)化,細(xì)菌和大部分古細(xì)菌衍生出了CRISPR-Cas系統(tǒng),用于保護(hù)它們免受外源DNA和噬菌體的侵染。到目前為止,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)50%的細(xì)菌和超過90%的古細(xì)菌均攜帶有CRISPR-Cas系統(tǒng)。CRISPR是一段高度重復(fù)的DNA序列,兩端重復(fù)序列之間存在著各不相同的spacer序列,表達(dá)Cas蛋白家族的基因簇位于CRISPR位點(diǎn)的上游,其表達(dá)翻譯的幾種類型的Cas蛋白作為原核生物免疫應(yīng)答的效應(yīng)器發(fā)揮著重要作用。
當(dāng)細(xì)菌受到噬菌體的侵染時(shí),被釋放到細(xì)菌細(xì)胞質(zhì)中的噬菌體基因組的某段DNA序列被識(shí)別并整合到CRISPR的spacer區(qū)域,隨后轉(zhuǎn)錄出相應(yīng)的crRNA前體(pre-crRNA)。crRNA前體經(jīng)過修飾和加工,生成向?qū)NA(guide-RNA)。由于gRNA中存在一段來源于噬菌體基因組的序列,因此gRNA可以通過堿基的互補(bǔ)配對(duì)原則識(shí)別噬菌體的基因組。同時(shí)存在于細(xì)胞質(zhì)中的gRNA和Cas蛋白特異性結(jié)合,并靶向到噬菌體基因組參與DNA的切割與降解。
簡單來講,CRISPR-Cas9是一種分子生物學(xué)技術(shù),通過這種技術(shù)科研人員可以對(duì)細(xì)胞和生物體內(nèi)的基因進(jìn)行編輯。所謂的基因編輯就是通過某種生物手段和技術(shù),對(duì)生物體內(nèi)的遺傳物質(zhì)進(jìn)行修改。
基于原核生物的獲得性免疫系統(tǒng)研發(fā)出的CRISPR-Cas9技術(shù)只包含兩種重要的成分,一種是行使DNA雙鏈切割功能的Cas9蛋白,而另一種則是具有導(dǎo)向功能的sgRNA(single guide RNA)。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)同時(shí)表達(dá)sgRNA和Cas9蛋白時(shí),Cas9蛋白通過與sgRNA結(jié)合,靶向到目的DNA序列上發(fā)揮DNA雙鏈切割的功能。DNA序列被切割產(chǎn)生斷裂后,引發(fā)細(xì)胞內(nèi)部的DNA修復(fù)機(jī)制(DNA repair)。真核細(xì)胞同時(shí)存在著同源重組修復(fù)和非同源重組修復(fù)。在同源重組修復(fù)下,斷裂的染色體以另一條完整的姐妹染色單體為模板進(jìn)行DNA修復(fù),而在非同源重組修復(fù)下,斷裂出的DNA隨機(jī)修復(fù),引入新的堿基,使基因產(chǎn)生移碼突變。
從很久以前,生物學(xué)家們就熱衷于一種研究策略,那就是功能缺失策略(loss of function)。常規(guī)的理解是這樣的,當(dāng)我們想要去研究某個(gè)基因在整個(gè)基因組中的作用時(shí),只需要通過某種方法將這個(gè)基因從基因組中剔除,然后觀察去除這個(gè)基因之后,這個(gè)細(xì)胞或生物體會(huì)發(fā)生怎樣的變化,然后根據(jù)這些變化去推斷這個(gè)基因的功能?;蚯贸褪怯脕砻枋鰧⒛硞€(gè)或某些基因從基因組中剔除這件事,而基因敲除技術(shù)則是用于完成這件事的方法或技術(shù)。
在實(shí)際實(shí)驗(yàn)過程中,我們只需要將Cas9蛋白和設(shè)計(jì)好的gRNA同時(shí)“運(yùn)送”進(jìn)細(xì)胞中即可,接下來的就交給細(xì)胞自己去操作了。
1)RNP法。直接將大量的gRNA和Cas9蛋白,通過電轉(zhuǎn)的方式轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞
2)病毒法。構(gòu)建慢病毒(LV)敲除質(zhì)粒,經(jīng)病毒包裝和純化后轉(zhuǎn)染細(xì)胞,將sgRNA和Cas9蛋白元件整合到細(xì)胞基因組中,從而使細(xì)胞源源不斷地生產(chǎn)sgRNA和Cas9蛋白。
3)常規(guī)質(zhì)粒法。構(gòu)建常規(guī)敲除質(zhì)粒,通過電轉(zhuǎn)將其導(dǎo)入細(xì)胞,短時(shí)間內(nèi)表達(dá)gRNA和Cas9蛋白。
4)轉(zhuǎn)座子法(PiggyBac)。將攜帶有PB轉(zhuǎn)座子和piggyBac轉(zhuǎn)座酶(PBase)的質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,轉(zhuǎn)座酶促進(jìn)轉(zhuǎn)座,將高拷貝的Cas9蛋白和gRNA表達(dá)元件隨機(jī)整合到基因組,實(shí)現(xiàn)gRNA和Cas9蛋白的持續(xù)表達(dá)。
這四種方法各有優(yōu)劣,我們?cè)谶x擇時(shí)可根據(jù)所研究的靶基因及靶細(xì)胞的特性,選取適合自己研究要求的方法。這期的分享就到此為止,相信看到這大家對(duì)CRISPR-Cas9技術(shù)已經(jīng)有了不錯(cuò)的理解。
賽業(yè)生物作為一家綜合解決方案提供商,依托于品系豐富的基因編輯小鼠資源庫、高效且智能化的模式動(dòng)物定制平臺(tái)、藥物篩選評(píng)價(jià)小鼠模型平臺(tái)、一站式小動(dòng)物表型分析平臺(tái)、一站式無菌鼠技術(shù)服務(wù)平臺(tái)及先進(jìn)的細(xì)胞技術(shù)服務(wù)平臺(tái),建立了多位一體的創(chuàng)新性CRO平臺(tái)服務(wù)網(wǎng)絡(luò),以服務(wù)于腫瘤、免疫、代謝、內(nèi)分泌、心血管、神經(jīng)及傳染病等方向的科學(xué)研究及藥物研發(fā)篩選,并與全球100多個(gè)國家和地區(qū)的數(shù)萬名科學(xué)家及企事業(yè)單位建立了廣泛的合作,產(chǎn)品與技術(shù)已直接應(yīng)用于包括CNS(Cell, Nature, Science)三大期刊在內(nèi)的4800余篇學(xué)術(shù)論文。賽業(yè)生物已獲得ISO9001:2015和AAALAC雙認(rèn)證,確保向廣大專家學(xué)者提供的所有產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù)符合國際標(biāo)準(zhǔn)的同時(shí)也表達(dá)了我們尊重動(dòng)物福利和倫理,重視生物安全的負(fù)責(zé)任態(tài)度。
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