開云網(wǎng)站 開云網(wǎng)址瑞典烏普薩拉大學Johan Elf 和Michael J. Lawson研究團隊合作研究開發(fā)出基于時間分辨成像的CRISPRi篩選技術(shù)。該研究于2019年11月18日在線發(fā)表于國際學術(shù)期刊《自然方法學》。
研究人員展示了如何克服在微流控設(shè)備中經(jīng)過延時成像后的菌株文庫原位基因分型的問題。他們通過監(jiān)測平均每個敲低大于500個細胞周期的復制叉的位置,來確定235種不同的CRISPR干擾敲低如何影響大腸桿菌復制和分裂周期的協(xié)調(diào)。隨后的原位基因分型使他們能夠?qū)⒚糠N表型分布圖定位到特定的遺傳擾動,以確定哪些基因?qū)毎芷诳刂坪苤匾?。單細胞時間分辨實驗使他們能夠確定單細胞生長速率,細胞分裂大小和復制起始體積的分布。這項研究中介紹的技術(shù)可以實現(xiàn)大多數(shù)活細胞顯微鏡檢法的基因組規(guī)模篩選。
據(jù)介紹,由于活細胞顯微鏡和基因庫規(guī)模的基因組工程之間的差距,他們將基因型多樣性與生物學上重要的表型聯(lián)系起來的能力已受到嚴重限制。